أحدثت كلية الزراعة بدير الزور تحت مسمى كلية الزراعة الثانية بدير الزور بموجب المرسوم التشريعي رقم /2693/ تاريخ 13/7/1977 وكانت تتبع لجامعة حلب وبعد إحداث جامعة الفرات عام 2006 أصبحت تتبع لجامعة الفرات.
تُعدّ كلية الزراعة في جامعة الفرات إحدى الكليات العلمية الأساسية في المنطقة الشرقية، وقد أُنشئت بهدف إعداد كوادر متخصصة قادرة على تطوير القطاع الزراعي في محافظة دير الزور والمناطق المحيطة بها.
تضمّ الكلية نخبة من أعضاء هيئة التدريس والخبراء، وتقدّم برامج بكالوريوس ودراسات عليا في مختلف التخصصات الزراعية، بما يشمل: وقاية النبات، الإنتاج الحيواني، البساتين، المحاصيل، علوم الأغذية، الأراضي، البيئة والحراج، والهندسة الريفية.
وتوفر الكلية بنية مخبرية وتعليمية واسعة تساعد الطلاب على اكتساب المهارات التطبيقية والبحثية، إضافة إلى حقول تجريبية تستخدم في التدريب العملي وتنفيذ مشاريع التخرج. كما تسهم الكلية بدور فاعل في خدمة المجتمع الزراعي من خلال الأبحاث التطبيقية، وتنظيم الدورات والورشات العلمية، وإيجاد حلول للمشكلات الزراعية المحلية، بما يعزّز دورها كمركز علمي وتنموي في المنطقة الشرقية.
مدَة الدراسة لنيل الإجازة خمس سنوات دراسية .